diff/patch

cygwinでいけました。
その差分ファイルっていろんな形式があって、同じプロダクトにあわせないとダメだと思っていたのですが、最近はどれもいろんな形式に対応しているみたいですね。
context形式、unified形式、ed形式、RCS形式、Cソース形式、・・・多すぎｗ
http://www.linux.or.jp/JM/html/gnumaniak/man1/diff.1.html